389 ورقة بحثية
تقدم الورقة البحثية التاريخ الهيكلي لحقيقيات النوى (SHE)، وهو شجرة تطور ضخمة تعتمد على 300 تريليون محاذاة هيكلية للبروتينات، والتي تكشف عن نموذج ثنائي التجزئة لتطور حقيقيات النوى، وتحدد تسارعات هيكلية خاصة بكل سلالة، وتضع إطارًا كميًا لتقييم جودة البروتوم واختيار الكائنات النموذجية.
تقدم هذه الورقة مفهوم "الحمل الكامن" من المواقع المختارة إيجابياً، محاججةً بأنه يتجاوز بشكل كبير الأحمال الجينية التقليدية لدى البشر، ومقترحةً أن العمليات التطورية الكبرى قد تدفع معدلات الطفرات نحو قيمة مثالية للمجتمع حيث يتوازن الحمل الكامن مع الحمل الطفري.
تكشف هذه الدراسة لشمبانزي البرية أنه بينما ترتبط الروابط الاجتماعية القوية بانخاح مستويات التوتر (الكورتيزول) لدى الإناث، فإنها تتنبأ بشكل متناقض بارتفاع مستويات التوتر لدى الذكور، مما يتحدى الافتراض بأن الروابط الاجتماعية تمنح فوائد صحية عالمية عبر مختلف الجنسين والبنى الاجتماعية.
تستخدم هذه الدراسة نماذج طيور مطبوعة ثلاثية الأبعاد عبر بيئات جزر وبرية لتوضيح أنه في حين أن خطر الافتراس المرتفع في البر يختار ضد الريش البارز، فإن انخفاض ضغط الافتراس في الجزر لا يفسر بشكل كامل تطور ريش الطيور الأقل ألواناً في الجزر، مما يشير إلى وجود عوامل إيكولوجية وتطورية أخرى قيد العمل.
من خلال دمج تجميع الجينوم، والترانسكريبتوميات، والتنميط الإبيجينومي في حشرة *Cameraria ohridella*، تكشف هذه الدراسة أن مناطق الكروموسومات الجنسية السلفية والحديثة توظف آليات تعويض جرعة متميزة — التثبيط عبر استنفاد H4K16ac على كروموسوم Z السلفي مقابل التنظيم التصاعدي عبر إثراء H4K16ac على كروموسوم neo-Z — مما يشير إلى أن الكروموسومات الجنسية الحديثة غالبًا ما تطور استراتيجيات تعويض جديدة شبيهة بآلية *Drosophila* بدلاً من تسخير الآليات السلفية الموجودة.